FreeNAS 的版本升級方式有二種。第一種是由 FreeNAS 官網下載最新版本的 ISO 檔燒錄至光碟片，再設定主機由光碟機開機，當系統偵測到光碟片中的安裝映像檔，其版本較現存版本為新，系統會自動進入版本升級模式，使用者僅需依照互動對話視窗的指示步驟，重新啟動主機即可完成升級。第二種升級方式為下載 GUI_upgrade.xz 韌體檔案（不需解壓縮），再登入 FreeNAS 圖形管理介面進行版本升級即可，在執行升級前，應先備份您的設定檔和資料數據，。
1.備份設定檔
【 由光碟升級】
1.先將FreeNAS虛擬機器關機
由Console端或瀏覽器WebGUI介面進行關機皆可
2.快立快照
由於 ESX snapshot 的方便性，當我們要針對 VM 作重大變更，擔心出問題時，當然可以藉由快照的幫助，讓自己後悔時可以回復當時狀況。
輸入快照名稱及說明
快照管理員
你可以選擇要快恢復的版本，升級如果出錯，可以恢復至上一快照點，還原至快照時的狀態
參考資料：關於 ESX 的快照問題
3.插入升級ISO檔，並更改Bios開機順序，將光碟改為優先
選擇要升級的版本，本例為FreeNAS9.2.1.8
將虛擬機器的開機選項設定為開機進入BIOS
虛擬機器開機後進入BIOS的畫面如下，將Boot頁籤下的的CD-ROM Drive按+移至最上方
將變更儲存後離開
從光碟開機，FreeNAS的版本為FreeNAS9.2.1.8，按 Install / Upgrade 進行升級
選擇要安裝系統的硬碟裝置，本例只有系統碟，未含其他硬碟裝置
選擇 Upgrade Install 進行升級，如選擇Fresh Install將不升級而直接安裝全新的系統
安裝前確認
升級系統中
進行系統升級
準備移除光碟，準備重新開機。不用急著將光碟缷除，關機再更改設定即可。
選4關機。
點選VM，選擇Edit Settings 進入修改硬體配置。
將 CD/DVD 改為 Client Device 本機裝置，開機進行測試。
【 由瀏覽器進行線上升級】
首先從FreeNAS官網下載升級檔Upgrade files，Download 下方的SHA256雜湊碼複製下來，線上升級時除了上傳升級檔，還需要輸入此SHA256雜湊碼進行核對，以確認升級上傳的檔案內容是否正確
點選左邊選單的【System】，再點選下方的【Settings】，接著點右邊的【Advanced】，按最下方的【Firmware update】，準備進行線上升級。操作介面語系若為繁體，升級的過程可能出現錯誤，必須在Console端，選單選10 ，將主機重新開機，再由瀏覽進行操作。
建議先至【System】的【Settings】，在【General】中將【Language 】中語系改為英文(English)，再來進行升級，
選擇要置放Firmware的暫存區，點先前建立的資料區即可，一般為/mnt/為開頭
選擇要上傳的更新檔，副檔名應為.txz
輸入下載更新檔網頁上的SHA雜湊碼，點Apply update 開始線上升級
更新中
更新完成，重新開機
線上升級完戊成
參考資料: